MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Magnetococcus marinus MC-1 chromosome

Total Repeats: 96237

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008576	CG	4	8	17	24	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_008576	TTC	2	6	30	35	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008576	GTTGTG	2	12	76	87	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008576	CCA	2	6	100	105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_008576	TGA	2	6	114	119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008576	GGC	2	6	124	129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008576	A	7	7	336	342	100 %	0 %	0 %	0 %	117923319
8	NC_008576	TGT	2	6	401	406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117923319
9	NC_008576	GCG	2	6	409	414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117923319
10	NC_008576	GGT	2	6	475	480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117923319
11	NC_008576	TGG	2	6	545	550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117923319
12	NC_008576	G	6	6	549	554	0 %	0 %	100 %	0 %	117923319
13	NC_008576	CGC	4	12	573	584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117923319
14	NC_008576	GCC	3	9	604	612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117923319
15	NC_008576	TGC	2	6	812	817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117923319
16	NC_008576	TGG	2	6	818	823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117923319
17	NC_008576	AGG	2	6	860	865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117923319
18	NC_008576	T	6	6	868	873	0 %	100 %	0 %	0 %	117923319
19	NC_008576	TGG	2	6	989	994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117923319
20	NC_008576	ACC	2	6	1005	1010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117923319
21	NC_008576	A	7	7	1040	1046	100 %	0 %	0 %	0 %	117923319
22	NC_008576	GGCA	2	8	1047	1054	25 %	0 %	50 %	25 %	117923319
23	NC_008576	CGA	2	6	1074	1079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117923319
24	NC_008576	T	6	6	1087	1092	0 %	100 %	0 %	0 %	117923319
25	NC_008576	ATT	2	6	1274	1279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117923319
26	NC_008576	ACCAC	2	10	1418	1427	40 %	0 %	0 %	60 %	117923319
27	NC_008576	A	6	6	1456	1461	100 %	0 %	0 %	0 %	117923319
28	NC_008576	GCA	2	6	1466	1471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117923319
29	NC_008576	GTG	2	6	1627	1632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117923320
30	NC_008576	CTG	2	6	1669	1674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117923320
31	NC_008576	CCG	2	6	1742	1747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117923320
32	NC_008576	AGC	2	6	1756	1761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117923320
33	NC_008576	TGG	2	6	1889	1894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117923320
34	NC_008576	AT	3	6	1907	1912	50 %	50 %	0 %	0 %	117923320
35	NC_008576	C	6	6	1915	1920	0 %	0 %	0 %	100 %	117923320
36	NC_008576	ACC	2	6	1930	1935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117923320
37	NC_008576	GAT	2	6	1977	1982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117923320
38	NC_008576	TGC	2	6	2042	2047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117923320
39	NC_008576	GCC	2	6	2059	2064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117923320
40	NC_008576	GGA	2	6	2160	2165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117923320
41	NC_008576	ATT	2	6	2179	2184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	117923320
42	NC_008576	AGA	2	6	2220	2225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117923320
43	NC_008576	GAT	2	6	2227	2232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117923320
44	NC_008576	CTG	2	6	2362	2367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117923320
45	NC_008576	GGT	2	6	2394	2399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117923320
46	NC_008576	GAT	2	6	2406	2411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117923320
47	NC_008576	CT	3	6	2416	2421	0 %	50 %	0 %	50 %	117923320
48	NC_008576	AGG	2	6	2495	2500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117923320
49	NC_008576	GAG	2	6	2626	2631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117923320
50	NC_008576	GTTG	2	8	2640	2647	0 %	50 %	50 %	0 %	117923320
51	NC_008576	TGTA	2	8	2672	2679	25 %	50 %	25 %	0 %	117923320
52	NC_008576	TGA	2	6	2698	2703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117923320
53	NC_008576	CTG	2	6	2843	2848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117923321
54	NC_008576	CGG	2	6	2867	2872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117923321
55	NC_008576	GCG	2	6	2890	2895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117923321
56	NC_008576	CACGG	2	10	2932	2941	20 %	0 %	40 %	40 %	117923321
57	NC_008576	T	6	6	2963	2968	0 %	100 %	0 %	0 %	117923321
58	NC_008576	GGC	2	6	2979	2984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117923321
59	NC_008576	CGG	2	6	3015	3020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117923321
60	NC_008576	GGC	2	6	3043	3048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117923321
61	NC_008576	GCG	2	6	3100	3105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117923321
62	NC_008576	CAG	2	6	3143	3148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117923321
63	NC_008576	GGT	2	6	3166	3171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117923321
64	NC_008576	GCT	2	6	3211	3216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117923321
65	NC_008576	TGGC	2	8	3245	3252	0 %	25 %	50 %	25 %	117923321
66	NC_008576	TTC	2	6	3309	3314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	117923321
67	NC_008576	CGG	3	9	3432	3440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117923321
68	NC_008576	CCG	2	6	3451	3456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117923321
69	NC_008576	GCG	2	6	3484	3489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117923321
70	NC_008576	GTG	2	6	3492	3497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117923321
71	NC_008576	GAT	2	6	3521	3526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117923321
72	NC_008576	GCA	2	6	3577	3582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117923321
73	NC_008576	AGC	2	6	3633	3638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117923321
74	NC_008576	GAT	2	6	3665	3670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117923321
75	NC_008576	CGG	3	9	3672	3680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	117923321
76	NC_008576	C	6	6	3789	3794	0 %	0 %	0 %	100 %	117923321
77	NC_008576	GT	3	6	3816	3821	0 %	50 %	50 %	0 %	117923321
78	NC_008576	GAG	2	6	3833	3838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117923321
79	NC_008576	TGA	2	6	3857	3862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117923321
80	NC_008576	GCT	2	6	3893	3898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	117923322
81	NC_008576	TGA	2	6	3921	3926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117923322
82	NC_008576	GGT	2	6	3958	3963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117923322
83	NC_008576	TGA	2	6	4020	4025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117923322
84	NC_008576	GTAG	2	8	4030	4037	25 %	25 %	50 %	0 %	117923322
85	NC_008576	CA	4	8	4075	4082	50 %	0 %	0 %	50 %	117923322
86	NC_008576	A	6	6	4174	4179	100 %	0 %	0 %	0 %	117923322
87	NC_008576	A	6	6	4224	4229	100 %	0 %	0 %	0 %	117923322
88	NC_008576	CTA	2	6	4281	4286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117923322
89	NC_008576	ACC	2	6	4321	4326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117923322
90	NC_008576	CAA	2	6	4328	4333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117923322
91	NC_008576	GGGGT	2	10	4338	4347	0 %	20 %	80 %	0 %	117923322
92	NC_008576	TGG	2	6	4479	4484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117923322
93	NC_008576	TGGTC	2	10	4692	4701	0 %	40 %	40 %	20 %	117923322
94	NC_008576	TTGA	2	8	4780	4787	25 %	50 %	25 %	0 %	117923322
95	NC_008576	GCA	2	6	4818	4823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	117923322
96	NC_008576	CAC	2	6	4875	4880	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117923322
97	NC_008576	GCCC	2	8	4957	4964	0 %	0 %	25 %	75 %	117923322
98	NC_008576	C	6	6	4962	4967	0 %	0 %	0 %	100 %	117923322
99	NC_008576	ACC	2	6	5034	5039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117923322
100	NC_008576	CAC	2	6	5049	5054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117923322
101	NC_008576	GGCAA	2	10	5084	5093	40 %	0 %	40 %	20 %	117923322
102	NC_008576	AC	3	6	5234	5239	50 %	0 %	0 %	50 %	117923323
103	NC_008576	TC	3	6	5244	5249	0 %	50 %	0 %	50 %	117923323
104	NC_008576	AAC	2	6	5341	5346	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117923323
105	NC_008576	CT	3	6	5478	5483	0 %	50 %	0 %	50 %	117923323
106	NC_008576	C	7	7	5645	5651	0 %	0 %	0 %	100 %	117923323
107	NC_008576	GGA	2	6	5660	5665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117923323
108	NC_008576	A	6	6	5670	5675	100 %	0 %	0 %	0 %	117923323
109	NC_008576	TTG	2	6	5685	5690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117923323
110	NC_008576	CAA	3	9	5696	5704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117923323
111	NC_008576	ACA	2	6	5887	5892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117923323
112	NC_008576	AG	3	6	5900	5905	50 %	0 %	50 %	0 %	117923323
113	NC_008576	CAAC	2	8	5968	5975	50 %	0 %	0 %	50 %	117923324
114	NC_008576	GAT	2	6	6039	6044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117923324
115	NC_008576	GGT	2	6	6074	6079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117923324
116	NC_008576	AGA	2	6	6200	6205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	117923324
117	NC_008576	GCC	2	6	6216	6221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117923324
118	NC_008576	GGT	2	6	6285	6290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117923324
119	NC_008576	GGT	2	6	6311	6316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	117923324
120	NC_008576	G	7	7	6355	6361	0 %	0 %	100 %	0 %	117923324
121	NC_008576	CCA	2	6	6371	6376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117923324
122	NC_008576	ATC	2	6	6382	6387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117923324
123	NC_008576	ACC	2	6	6441	6446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	117923324
124	NC_008576	CT	3	6	6507	6512	0 %	50 %	0 %	50 %	117923324
125	NC_008576	TCCT	2	8	6531	6538	0 %	50 %	0 %	50 %	117923324
126	NC_008576	GAT	2	6	6576	6581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117923324
127	NC_008576	TTG	2	6	6622	6627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117923324
128	NC_008576	C	6	6	6660	6665	0 %	0 %	0 %	100 %	117923324
129	NC_008576	CCG	2	6	6697	6702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117923324
130	NC_008576	CAA	2	6	6755	6760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117923324
131	NC_008576	CAA	2	6	6824	6829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	117923324
132	NC_008576	AAT	2	6	6843	6848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	117923324
133	NC_008576	A	6	6	6855	6860	100 %	0 %	0 %	0 %	117923324
134	NC_008576	GAT	2	6	6882	6887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117923324
135	NC_008576	CCG	2	6	6904	6909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	117923324
136	NC_008576	TTCTC	2	10	6939	6948	0 %	60 %	0 %	40 %	117923324
137	NC_008576	GTT	2	6	6987	6992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	117923324
138	NC_008576	T	6	6	7023	7028	0 %	100 %	0 %	0 %	117923324
139	NC_008576	GAG	2	6	7029	7034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	117923324
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259	NC_008576	TTTA	2	8	12188	12195	25 %	75 %	0 %	0 %	117923329
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261	NC_008576	GATGA	2	10	12248	12257	40 %	20 %	40 %	0 %	117923329
262	NC_008576	ATG	2	6	12329	12334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	117923329
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264	NC_008576	ATC	2	6	12359	12364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	117923329
265	NC_008576	CAAGGG	2	12	12436	12447	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	117923329
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267	NC_008576	C	6	6	12508	12513	0 %	0 %	0 %	100 %	117923329
268	NC_008576	GCAC	2	8	12518	12525	25 %	0 %	25 %	50 %	117923329
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270	NC_008576	CCA	2	6	12667	12672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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